В девяностые годы «Нива» преимущественно выступала в высшей лиге чемпионата Украины. В тот период лишь в сезоне 19921993 она была в первой лиге, где вновь оказалась с сезона 1997/1998 по 2004/2005.
Наиболее яркий период клуба - это 1996 год. Весной «Нива» обыграла в полуфинале Кубка Украины донецкий «Шахтер» (0:0, пен. - 3:0). В финале винничане уступили «Динамо» (0:2), но завоевали право выступать в Кубке обладателей Кубков, где команда сначала победила эстонский «Саддам» (1:2, 1:0), а в 1/16 уступила швейцарскому «Сьону» (0:2, 0:4)
В 1997 году «Нива» заняла последнее место и вылетела в первую лигу, в которой выступала 8 сезонов подряд. В первые годы команда была близка к возвращению в высшую лигу. Но этого не произошло. В 1999 году команда сменила название на ФК «Винница», и выступала под этим названием до 2003 года, впоследствии вернув старое название. Однако и это не помогло. В 2005 годуу клуба возникли проблемы с финансированием команды, и два года «Нива» пребывала в любительском статусе. Начиная с сезона 2007/08 годов, возрожденная команда с новым названием «Нива-Свитанок» начала играть во второй украинской лиге.
В 2008 году клубу вернули историческое название «Нива».
В 2010 году винницкая «Нива» и «Горняк-Спорт» встретились в финале первого розыгрыша «UMBRO-Кубка Лиги, прошедшем в Александрии. Тогда со счетом 4:0 победителем стала команда из Винницы. В ее составе выступали такие футболисты как Андрей Пилявский, Дмитрий Козьбан, Руслан Качур, Вадим Бовтрук, Сергей Герасимец и другие.
Ныне главным тренером команды является Денис Колчин, который знаком по работе в одесской «Жемчужине». Колчин работал в «Ниве» с 2017-го года. В сезоне 2016/17 он был признан лучшим тренером Второй лиги.
Кстати, пути Сергея Пучкова и нынешнего наставника «Нивы» пересекались в матче первого круга минувшего чемпионата. Тогда в Одессе успех был на стороне «горняков» (2:1). Нашей обороне стоит внимательно следить за форвардом винничан Михаилом Шестаковым, который нам очень хорошо знакомп по играм за ту же «Жемчужину» и в минувшем чемпионате забил в ворота «Горняка-Спорт» три мяча (один вы первом круге и дубль в игре второго круга).
Президентом клуба является уроженец Винницкой области - генерал-майор Службы безопасности Украины Василий Вовк, являющийся также заслуженным юристом Украины и экспертом по вопросам госбезопасности. Руководитель винницкого клуба весьма активно ведет свою страничку в социальной сети facebook. После «сухой» ничьей с «Вересом» Василий Васильевич написал пост, в котором отправил в отставку нынешнего главного тренера Дениса Колчина и пригрозил снять с соревнований клуб. Но то, видимо, были эмоции, поскольку изменений в тренерском штабе не произошло, а винницкий клуб удачно провел последующие поединки.
«Горняк-Спорт» выехал в Винницу вчера утром и после более чем девятичасового пути автобусом прибыл на место события. Команда поселилиась в гостинице «Оптима», в которой есть все условия для того, чтобы комфортно отдохнуть от дальнего пути и в хорошем состоянии подойти к ответственной сегодняшней игре. Кстати, в день приезда "горняки" успели провести тренировку, чтобы должным образом подготовиться к матчу и размять мышцы после длительного пути. Напомним, что подопечные Сергея Пучкова в хорошем настроении отправились в Винницу после победы в игре чемпионата Украины в Первой лиге над "Балканами" (1:0).
Что касается нашего соперника, то "Нива" в 5-м туре Второй лиге дома сыграла вничью (2:2) с "Подольем" из Хмельницкого. "Нива" с шестью очками идет на 6-м месте и имеет в активе 1 победу, 3 ничьих и 1 поражение с разницей мячей 5:4. Наш соперник проводит домашние матчи на Центральном городском стадионе, вмещающем 24 тысячи зрителей. Кстати, игра винничан с "Подольем" собрала 2500 зрителей.
Напомним, что матч второго предварительного раунда «Нива» (Винница) - «Горняк-Спорт» (Горишние Плавни) начнется в 17:00. Во время поединка планируется его прямая трансляция в Youtube.